领一支由十八艘舰船，一千二百名士兵组成的舰队到达满刺加。
在无礼的要求被拒绝后，葡萄牙人向满刺加发起了进攻。由于没掌握当地的潮汐时间，舰船无法进入河道，在满刺加的顽强抵抗下，葡萄牙第一次进攻失利。
但不久阿尔布克拉克就组织了第二次进攻，这次葡萄牙人进攻的是满刺加城的咽喉之地，满刺加河大桥葡萄牙人依靠强大的舰队，进入满刺加河，进而占领了大桥，满刺加国王见大势己去，只得丢下富甲天下的满刺加城，率领残部退到巴莪。
而占领满刺加城的葡萄牙人则开始了抢劫行动，这次抢劫，掠夺了满刺加国三分之二的财富。抢劫过后，葡萄牙人又进行了屠城。
至此，大明彻底丧失了对满刺加的控制。
后来满刺加国王的后裔来到柔佛，建立柔佛王国，1551年柔佛联合各种势力对付驻满刺加的葡军，曾一度夺回满刺加的控制权并坚守了三个月。
在葡萄牙占领满刺加以后的一百多年中，争夺满刺加的战争从未停止过，各国势力都曾参与争夺。
1597年，荷兰人第一次向驻满刺加的葡萄牙军发起攻击，其后又联合柔佛向满剌加发起进攻，直到1641年满刺加才彻底落入荷兰人的手中。
丢失满刺加对大明来说并非只是失去一个藩属国这么简单，因为满刺加海峡对大明来说有着重要的战略意义，大明帝国三分之二的属国都在东南亚。
在朝贡贸易中，大明从东南亚的属国那里得到了大量的矿产，木材，香料，黄金，珠宝和大米。而大明则向这些属国出口和转口了大量的瓷器，绸缎，茶叶。在获得巨大利益的同时，还发展了制瓷业，纺织业，制茶业和造船业。
尤为关键的是，大明在东南亚进行海上贸易活动时，不仅建立了一个由大明主导的庞大的贸易体系，同时也建立了一个巨大的战略缓冲区。
而失去了满刺加的大明帝国，从此海上门户大开，再也无法阻挡西方殖民者的东来。随后不久，葡萄牙人便穿过南中国海，出现在广东沿岸。
刚到大明的葡萄牙人依然采取暴力手段讲行殖民掠夺，不可避免地跟大明政府发生了冲突。
正德十七年，中葡屯门之战爆发，大明以五十余艘战船将屯门包围，向葡军发起进攻，葡军伤亡惨重，只得抛弃大部船只，仅乘三艘大船趁夜潜逃。
次年，葡萄牙再次派出舰队来到大明东南沿海，与大明水师发生激战，大明水师再次获胜，葡萄牙人退到舟山群岛的双屿建立居留地，进行走私活动。
嘉靖二十七年，大明水师进攻双屿，将那里的建筑及港口的船只全部焚毁，并将港口堵死。
经过三次败仗，葡萄牙人终于认识到大明的强大，再也不敢对大明使用武力，
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